Το Επιστημονικό Συμβούλιο του Ινστιτούτου (ΕΣΙ) συστάθηκε σύμφωνα με την απόφαση 100/2020-2294, 13/07/2020 της ΔΔ/Τμ. Προσωπικού του ΕΚΕΦΕ «Δ» και λειτουργεί σύμφωνα με τις διατάξεις του Ν. 4386/2016 και τον Εσωτερικό Κανονισμό του Κέντρου. Η σύνθεσή του είναι η ακόλουθη (1ο πρακτικό συνεδρίασης του ΕΣΙ, 16-07-2020) :
· Χάρης Πρατσίνης (Πρόεδρος)
· Γεράσιμος Βουτσινάς (Μέλος)
· Μαρία Κωνσταντοπούλου (Μέλος)
· Βασιλική Λαμπροπούλου (Μέλος)
· Αθηνά Τζίνια (Μέλος)
· Αθανασία Κωστάκου (Αιρετή εκπρόσωπος από το επιστημονικό, τεχνικό και διοικητικό προσωπικό)