(Συντονίστρια: Δρ. Μ. Βλάση)
Το μάθημα περιλαμβάνει τις παρακάτω ενότητες:
Ενότητα 1: «Εισαγωγή στην Υπολογιστική Βιολογία»
(Διδάσκων Δρ. Ι.Αλμυράντης), 10-12 ώρες.
Περιεχόμενα:
Σχέσεις φαινοτύπου - γονοτύπου ■ Γονιδίωμα και εξέλιξη ■ Γλωσσολογικές ιδιότητες του «γονιδιωματικού κειμένου» (πλεοναστικότητα, πολλαπλή κωδικοποίηση, πολικότητα, Νόμοι τύπου "Zipf " κλπ) ■ Συχνότητες ν-άδων νουκλεοτιδίων στο γονιδίωμα ■ Γονιδιωματική υπογραφή ■ Αποκλίσεις από την τυχαιότητα των γονιδιωματικών ακολουθιών: εξάρτησή τους από την κλίμακα και η λειτουργική σημασία της εξάρτησης αυτής ■ Προέλευση της ζωής ως διαπλοκής πρώιμων «φαινοτύπων» και «γονιδιωμάτων» - σημασία της αυτοοργάνωσης.
Ενότητα 2: Εισαγωγή στην Κρυσταλλογραφία Πρωτεϊνών και στην 3D-Μοντελοποίηση Δομής
(Διδάσκουσα: Δρ. Μ. Βλάση), 10-12 ώρες
Περιεχόμενα:
Εισαγωγή στην πρωτεϊνική δομή I ■ Βασικές αρχές της Κρυσταλλογραφίας Πρωτεϊνών ■ Εισαγωγή στη θεωρητική μοντελοποίηση πρωτεϊνικής δομής ■ Παραδείγματα (παρουσίαση σχετικών δημοσιεύσεων): Εφαρμογή της Κρυσταλλογραφίας πρωτεϊνών και της θεωρητικής μοντελοποίησης δομής σε πρωτεΐνες ιατρικού ενδιαφέροντος και διαλεύκανση της σχέσης δομής-λειτουργίας.
Η εξέταση των φοιτητών βασίζεται σε παρουσιάσεις (προφορικές ή γραπτές) σχετικής βιβλιογραφίας καθώς και στην συμμετοχή τους στο μάθημα.
Ενότητα 3: "Εισαγωγή στην Φασματοσκοπία NMR"
(Διδάσκουσα: Δρ. Μ. Πελεκάνου), 10-12 ώρες
Περιεχόμενο:
Βασικές αρχές της φασματοσκοπίας ΝΜR ■ Εφαρμογή της φασματοσκοπίας NMR στην διαλεύκανση της δομής πρωτεϊνών ■ Επίδειξη λειτουργίας του φασματομέτρου NMR 500 ΜΗz ■ Συζήτηση θέματος της διεθνούς βιβλιογραφίας σχετικού με την μελέτη της δομής πρωτεϊνών με NMR
Η βαθμολογία των φοιτητών βασίζεται στην απόδοσή τους σε γραπτές ασκήσεις επί της διδαχθείσας ύλης και στην συμμετοχή τους στο μάθημα.
